Научный комплекс Московского педагогического государственного университета представлен учебно-научными центрами, научно-образовательными центрами, научно-исследовательскими институтами, лабораториями.
Ключевой элемент научного комплекса МПГУ – научно-исследовательская часть (НИЧ), которая осуществляет свою деятельность в целях развития и повышения эффективности научных исследований и обеспечения единства научной и учебно-воспитательной работы в вузе.
Основными задачами научно-исследовательской части являются организация и проведение фундаментальных и прикладных исследований в области естественных, гуманитарных и технических наук, разработка актуальных проблем развития высшего образования, ускорение внедрения результатов научно-исследовательской работы (НИР), привлечение преподавателей, студентов и аспирантов к проведению НИР и создание условий для использования результатов исследования в учебном процессе.
Научно-исследовательская часть МПГУ проводит научные исследования в контакте с другими вузами, учреждениями РАН и РАО путем координации тематики НИР, организации совместных научных исследований, проведения конференций, совещаний и издания научных трудов.