Университет закрыл три филиала: в Брянске, Ульяновске и Краснодаре – этот процесс начался в 2012 году. С 1 сентября 2013 года во всех филиалах был прекращен прием студентов, а зимой 2015 года студенты сдали выпускные экзамены и защитили дипломы. На данный момент из «старых» филиалов остается Новосибирский филиал, где доучиваются 42 студента. Как только студенты получат свои дипломы, он также будет закрыт. Этот процесс направлен на повышение качества образования.
«Многие филиалы вузов не смогли обеспечить требуемое качество образования и закрываются. МПГУ в течение последних трех лет ведет работу по закрытию своих филиалов, не соответствующих законным требованиям Минобрнауки России. При закрытии обеспечиваются права студентов на продолжение учебы и преподавателей на трудоустройство. Министерство руководит процессом закрытия и его контролирует. Сейчас к МПГУ присоединяются филиалы МГГУ им. М. А. Шолохова. Среди этих филиалов есть жизнеспособные и эффективные, например, Шадринский», – рассказал ректор МПГУ Алексей Семенов.