Большой интерес для ботаников России и ученых других стран представляет гербарий МПГУ, начало которому было положено в 90-х годах ХIХ века. Он содержит более 110000 единиц хранения (гербарных листов) и занимает третье место среди гербариев Москвы (после Гербария МГУ и Гербария Главного ботанического сада РАН), включает в себя 70% флоры России.
Гербарий МПГУ внесен в список мировых Гербариев и имеет собственный международный индекс – MOSP. Гербарий пополняется в результате активных флористических исследований на территории России. Ежегодно по итогам экспедиций фонды увеличиваются более чем на 1000 листов.
В настоящее время гербарий превратился в одну из крупнейших в Москве и, несомненно, в самую крупную в педагогических университетах России коллекцию растений, имеющую фундаментальное значение для научных исследований.
