МГПИ им. В.И. Ленина, как и многие другие московские вузы, преодолев трудности военного времени, неимоверные физические и нравственные перегрузки, хроническое недофинансирование по основным статьям расходов, не только сохранил все свои факультеты и кафедры, но и существенно увеличил свой научную и педагогическую значимость в среде высшего академического образования.
Институт продолжал проводить исследования в области фундаментальной науки, нацеленные прежде всего на оборону страны. Результаты работ оптической лаборатории института, возглавляемой профессором Э.В. Шпольским, широко использовались войсками ПВО. Ученые кафедры анатомии и физиологии животных совместно с учеными нейрохирургического института открыли эффективные методы лечения тяжелых ранений. Кафедра общей и аналитической химии под руководством С.А. Балезина успешно провела исследования в области ингибиторов коррозии металлов и дала фронту новые материалы для покрытия корпусов кораблей, орудий и минометов. Сурдопедагоги вместе с военными врачами разрабатывали и успешно применяли методы восстановления слуха у оглохших от контузий и методы чтения для потерявших слух.
В 1942/43 учебном году массовые мобилизации студентов на фронт не проводились, а в сентябре 1943 года СНК СССР своим постановлением освободил студентов от призыва в армию. По неполным данным 5 вузов: МГУ им. М. В. Ломоносова, МГПИ им. В.И. Ленина, МГПИ им. К. Либкнехта, МОПИ им. Н.К. Крупской и Городской педагогический институт только в организованном порядке направили в армию к концу 1942 года более 3000 преподавателей, студентов и аспирантов (накануне войны в этих вузах училось около 11,6 тысяч студентов и работало около 1,6 тысяч преподавателей). Таким образом, процент мобилизованных от общей довоенной численности студентов и преподавателей составил 25%. Многие из них не вернулись с фронта. Память о них священна для тех, кто сейчас работает и учится в МПГУ. В знак вечной славы преподавателей, студентов, аспирантов и сотрудников института, отдавших свою жизнь в борьбе за свободу и независимость нашей Родины, в Главном корпусе МПГУ были открыты две мемориальные доски и установлены памятники Героям Советского Союза В.Л. Белик и Н.Ф. Рубцову.
