Все ученики 8-11 классов осваивают базовый уровень общеобразовательной программы. Восьмиклассники проходят профориентациононый курс, по окончании которого выбирают профиль обучения. Ученики 9-11 классов осваивают одну из профильных программ, по которой планируют продолжить своё образование в университете:
- гуманитарный (журналистика) (профильные предметы: теле-радио-журналистика, интернет-журналистика);
- гуманитарный (история) (профильные предметы: история, МХК);
- гуманитарный (филология) (профильные учебные предметы: русский язык, языкознание, русская литература, зарубежная литература, иностранные языки (основной и дополнительный);
- естественно-научный (профильные учебные предметы: химия, биология, экология);
- педагогический (профильные предметы: обществознание, биология, история педагогики, основы психологии);
- социально-экономический (профильные учебные предметы: география, история, обществознание, экономика, право);
- технологический (профильные учебные предметы: физика, математика, информатика и ИКТ, черчение (элективный курс);
- технологический: подготовка к обучению “фундаментальная физика на английском языке” по программам высшего образования (профильные учебные предметы: физика, математика, информатика и ИКТ, специальный английский);
- художественный (профильные учебные предметы: МХК, живопись/рисунок/скульптура, декоративно-прикладное искусство, компьютерный дизайн и конструирование, черчение (элективный курс).
Освоение профильных программ организовано на базе институтов и факультетов университета при участии преподавателей МПГУ (см. “Университетская среда Лицея”).