Кафедра естественнонаучного образования и коммуникативных технологий основана на базе кафедры методики преподавания биологии в связи с созданием Института биологии и химии и объединением с химическим факультетом и впоследствии с МГГУ им. М.А.Шолохова.
Кафедра методики преподавания биологии была основана в 1943 году для подготовки студентов по общим и частным методикам преподавания биологии, включая летнюю полевую и педагогические практики на всех курсах. Возглавил кафедру видный педагог и методист того времени М.Я. Цузмер, автор учебника «Зоология» для средней школы. В 1935 году М.Я. Цузмером в соавторстве была написана первая методика преподавания анатомии и физиологии человека, а также общая методика преподавания биологии. М.Я. Цузмер возглавлял кафедру до 1946 года. С 1946 по 1960 год заведующим кафедрой был В.А. Тетюрев, затем А.И. Никитюк.
В 1960 г., после слияния МГПИ с Потемкинским институтом, заведующим кафедрой стал профессор Б.В. Всесвятский, с приходом которого возрос научный потенциал кафедры, а также продолжалась подготовка педагогических кадров для высшей школы. В этот период на кафедре работали такие видные педагоги-методисты, как Л.А. Луцкая, О.Л. Петришина, Л.П. Смирнова, П.И. Суворова, Н.С. Филатова и др.
С 1966 по 1973 гг. кафедрой руководил И.Г. Белов. Продолжался рост научных кадров кафедры. С 1974 по 1984 гг. кафедрой руководила еще одна ученица Б.В. Всесвятского – М.М. Левина. В этот период в аспирантуре при кафедре обучаются и защищают кандидатские диссертации педагоги из Болгарии, Вьетнама, Индии.
С 1984 года по 2014 год кафедру возглавлял профессор А.И. Никишов – ученый-педагог, методист, автор многочисленных учебников и учебных пособий по биологии для средней школы: «Биология. Животные», «Естествознание» и др. На кафедре сложился дружный коллектив единомышленников, который в 1991 году учредил Российскую Ассоциацию учителей биологии.
