- Научно-методический центр сопровождения педагогических работников
- Всероссийский научно-методический центр «Философия образования»
- Федеральный координационный центр по подготовке и сопровождению вожатских кадров
- Центр регионального сотрудничества
- Центр развития открытого образования
- Центр кинопедагогики и медиакультуры МПГУ
- Центр профилактики религиозного и этнического экстремизма в образовательных организациях Российской Федерации
- Центр психолого-педагогического сопровождения студентов с ограниченными возможностями здоровья
- Центр педагогического сетевого взаимодействия
- Центр развития международных образовательных программ
- Центр развития дистанционного образования
- Центр социальных инициатив МПГУ
- Центр поисковой работы и историко-культурного туризма
- Центр археологических исследований
- Центр историко-культурных исследований религии и межцивилизационных отношений
- Центр регионоведения и гуманитарно-образовательного сотрудничества
- Центр довузовской подготовки иностранных граждан по русскому языку
- Центр русского языка и культуры им.А.Ф.Лосева
- Консультативно-диагностический центр для детей и взрослых с ограниченными возможностями здоровья
- Физкультурно-оздоровительный реабилитационный центр
- Центр социализации, семьи и профилактики асоциального поведения
- Центр математического образования
- Центр «Информатика и образование»
- Центр психологической помощи населению
- Российско-китайский координационно-методический центр
- Центр тестирования МПГУ
- Центр учебного книгоиздания и информационно-образовательной среды
- Международный центр педагогического образования
